تهدف إدارة المجلات والمؤتمرات العلمية الى تعزيز دور جامعة المرقب في الريادة والتميز البحثي والمعرفي من خلال انشاء وتطوير وتأهيل المجلات العلمية التي تصدرها الجامعة ودعمها لنشر الأبحاث المتميزة التي تتسم بالجودة والأصالة والابتكار. كما تسعى هذه الإدارة إلى أن تكون المجلات العلمية عالمية ومدرجة في قواعد البيانات العالمية مثل شبكة العلوم ((WoS) و(SCOPUS)) مما يسهم في تحسين سمعة الجامعة وابرازها في لوسط الأكاديمي العالمي وتتكون إدارة المجلات والمؤتمرات العلمية من مكتب المجلات العلمية ومكتب المؤتمرات العلمية.